食物連鎖は自然界のシステムであり、生物種の関係性における「食べる」「食べられる」を表現する言葉である。食物連鎖には階層があり、大きく分けて3つに分類される。それぞれ『消費者』『生産者』『分解者』と呼ばれる。生物の量を図にするとピラミッドのような形になる。これを生態系ピラミッドと呼び、上位であるほど広大な土地(餌場)を必要とし、数が減っていく。そのため、下位の生物がその数を減らしピラミッドの形が歪な物に変化した場合、この食物連鎖によって自然は回っている。目に見えないほど小さい生き物、大きな生き物、人類など全ての生き物は必ず食物連鎖の輪の中に入っている。例外は無い。
生態系をピラミッドで表現した。しかし、本来の生態系は下から上に一直線で表現されることはなく、実際には網の目のように複雑に絡んでいる(食物網)。
水中の生態系で特に重要なのが、「プランクトン」の存在である。このプランクトンは、水の中を漂って生活している生物の総称であるが、2種類に分けることが出来る。「植物プランクトン」と「動物プランクトン」である。これらプランクトンは一部が分解者であるが、水中の全生態系を、栄養の供給者として支える、とても重要な生物である。

細菌類(バクテリア)、菌類(カビや酵母など)、貝類などを総称して分解者と呼ぶ。甲殻類と水生昆虫を分解者として分類することもあるが、ここでは2次消費者として分類し、区別している。しかし、分解者としての働きが両種にあることも事実である。
分解者がいなければ、水の中は生物の死骸や落ち葉などの有機物で溢れ、水質が悪化し、生物が生息できる環境ではなくなってしまう。貝類や甲殻類、水生昆虫などが有機物を細かくして食べることで、微生物が分解する手助けとなる。有機物を無機物へと分解することで、水生植物にとっての養分となる。
水槽で水生生物を飼育する場合や、下水・排水処理上では、この微生物を利用して水の浄化作業が行われている。
生産者
水中の生物たちにも必要なモノが酸素である。水中への酸素の供給の仕方は色々あり、水面から水中へと混ざり合うこと、水生植物による光合成、滝による攪拌、人為的な供給によって水中へと酸素は送り込まれている。 分解者の働きによって有機物を水、二酸化炭素、窒素やリンなどの栄養分へと分解する。この栄養分を吸い上げることで、水生植物は成長し、水中へと酸素を供給している。
水生植物は「抽水植物」、「浮葉植物」、「浮遊(浮漂)植物」、「沈水植物」の4種類に分類される。

抽水植物:アギナシ、オモダカ、ガマ、コガマ、ヒメガマ、カンガレイ、キカシグサ、コナギ、ショウブ、ヘラオモダカ、ミクリ など
浮葉植物:ジュンサイ、ヒルムシロ、イチョウウキゴケ、ホソバミズヒキモ など
浮遊(浮漂)植物:タヌキモ、イヌタヌキモなど
沈水植物:バイカモ、ミズオオバコ、ヤナギスブタ、ヤナギモ など
目に見えるかたちの水生植物だけでなく、植物プランクトンが水中には多く存在している。陸上と違うのは、このプランクトンの存在である。植物プランクトンは光合成をして酸素を水中へと放出している。また、水生生物の多くがこの植物プランクトンを糧としている。
植物プランクトン:アオミドロ、ミカヅキモ、ツヅミモ、ミドリムシなど

消費者
陸上での食物連鎖と同様に、3つに分類した。
第1次消費者
動物プランクトンがあてはまり、主に植物プランクトンを食べている。植物プランクトンと動物プランクトンの分類は、光合成を行っているかどうかで判別している。
動物プランクトン:ミジンコ類、ケンミジンコ、ワムシ、ゾウリムシ、ツリガネムシ

草食と肉食の水生昆虫、エビやカニといった甲殻類をあてはめた。甲殻類と水生昆虫をここでは2次消費者として分類している。
草食の水生昆虫
カワゲラ類:オナシカワゲラ
カゲロウ類:エルモンヒラタカゲロウ、フタスジモンカゲロウ など
トビケラ類:ヒゲナガカワトビケラ、ニンギョウトビケラ など
その他:クロバアミカ、ヒラタドロムシ、ガガンボ類 など
肉食の水生昆虫
カワゲラ類:キカワゲラ、カワゲラ、トワダカワゲラ などトビケラ類:ムナグロナガレトビケラ、ヒロアタマナガレトビケラ など。その他:ヘビトンボ、ヤゴ類、ナベブタムシ、タイコウチ、ミズカマキリ、タガメ、 ホタルの幼虫、シマイシビル、ウマビル

エビ類:スジエビ、ヌマエビ、ホウネンエビ、キタヨコエビ
カニ類:サワガニ

第3次消費者
イワナやヤマメのような肉食の中型魚類や、ウグイなどの雑食の中型~小型魚類を分類した。

自然界の高位消費者
ナマズやウナギのような大型の肉食魚類を分類した。

湖沼や流れのゆるい河川の中、下流域に生息している。夜行性で、肉食魚。小魚、甲殻類、カエルやヘビなど、その口に入るものなら何でも捕食する、大食漢である。

ウナギの生態については謎が多く、特に産卵場所については長年の謎とされてきた。降河回遊魚のウナギは産卵のために海へと降り、再び川や湖沼へと戻ってくる。この産卵場所が特定されたのは2005年のことであり、西マリアナ海嶺付近だと考えられている。
参考文献
永田俊 1993 『微生物ループと水圏物質循環―溶存有機物の生成と分解をめぐって―』 Bulletin of Japanese Society of Microbial Ecology 8 149-155
土壌微生物研究会 1997 『新・土の微生物(2) 植物の育成と微生物』 博友社
田中正明 2002 『日本淡水動植物プランクトン図鑑』 名古屋大学出版会
加藤雅啓・海老原淳 2011 『日本の固有植物』 東海大学出版会
苗場山麓ジオパーク振興協議会 2018 『苗場山麓植物民俗事典』 ほおずき書籍

